Οι επιστήμονες εξέφρασαν την έκπληξή τους για την ηλικία των οστών, αλλά επισήμαναν πως μόνο αυτό δεν αρκεί για να βεβαιώσουν ότι ανήκουν στον Ιωάννη. Η ανακάλυψη των οστών έγινε στη διάρκεια ανασκαφών το 2010 κάτω από εκκλησία στο νησί της Βουλγαρίας Σβέτι Ιβάν, που σημαίνει Αγιος Ιωάννης. Κάτω από την Αγία Τράπεζα βρέθηκε μια μικρή μαρμάρινη σαρκοφάγος, η οποία περιείχε ανθρώπινα οστά--μια φάλαγγα, το μπροστινό μέρος ενός κρανίου, ένα δόντι, αλλά και τρία οστά ζώων.